A Parasitologia é a área do Laboratório Clínico que identifica os parasitos que habitam o organismo dos animais e causam efeitos prejudiciais à sua saúde. Os ectoparasitas são parasitas instalados na superfície externa do organismo ou em cavidades, enquanto os endoparasitas são agentes que se desenvolvem no interior do organismo, sendo responsáveis por verminoses.

Exames coproparasitológicos e raspados de pele são os carros-chefes deste setor.